〇研究棟

研究所としての機能が集約されているメインの建物。

海洋地形や生物などの調査を行うための設備であり

各種さまざまな研究室が備わる。

また、ジャンピーたち特務隊の基地としての機能もある。

〇水族館棟

この部分は水族館であり、市民に一般開放されている。

デートスポットとしても人気の場所。

また、ただ海洋生物を展示するだけでなく海底の地形など

様々なテーマの展示がある。

〇ステージプール

海獣ショー(イルカショー、アシカショー、シャチショー)が行われる大型ステージ。

シロイルカのナツミ、バンドウイルカのコー、アシカのメアリ、シャチのザインが人気。

〇ペンギンプール

各種ペンギンを飼育している。

〇スカイデッキ

水族館棟の屋上にある。広大な海を見渡せる展望台であり、カフェなどが備わっている。

なおこれとは別に研究棟の屋上にも職員専用の展望デッキがある。

〇レストラン「オーシャンブルー」

スカイデッキのすぐ下の階にあるシーフードレストラン。

シーフードばかりというわけでもなく肉料理もしっかり用意されている。

利用客が思い思いに料理を盛り付けてテーブルへ持っていく「ブッフェ方式」。